RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXQ1Q9C009 403 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 EMCNQ9ULC0 261 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-25P01717 112 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP17A1P05093 508 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN9P43378 593 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IDH3AP50213 366 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A3Q00325 362 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CDO1Q16878 200 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC8BQ6P9F7 803 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PACS1Q6VY07 963 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 BEND5Q7L4P6 421 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM25Q86YD3 366 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 BHMTQ93088 406 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF778Q96MU6 729 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DAB1O75553 588 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAM1P18669 254 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNIQ14094 377 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PCLAFQ15004 111 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDGFRLQ15198 375 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GAB4Q2WGN9 574 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP157Q5JU67 520 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 LY6G5CQ5SRR4 150 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW8Q8N3Y1 598 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FLCNQ8NFG4 579 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A7Q8TE54 656 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FERMT1Q9BQL6 677 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-27P01718 113 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GJA4P35212 333 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SCNN1AP37088 669 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MATKP42679 507 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX4P57082 545 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MESP2Q0VG99 397 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA9Q13797 1035 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DHCR24Q15392 516 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDPK2PQ6A1A2 396 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TPGS1Q6ZTW0 290 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A13Q96H72 371 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAP29Q9UHQ4 241 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DMDP11532 3685 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PI15O43692 258 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 STK10O94804 968 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PROCP04070 461 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 VCLP18206 1134 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NME3Q13232 169 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP5Q8N3R9 675 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RTKNQ9BST9 563 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DDIT4Q9NX09 232 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 IRAK2O43187 625 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ITM2AO43736 263 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 USP1O94782 785 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CTHP32929 405 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NOS2P35228 1153 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 HK2P52789 917 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 STON2Q8WXE9 905 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NPY6RQ99463 290 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9H521 79 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PLK2Q9NYY3 685 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 COPG2Q9UBF2 871 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 POMPQ9Y244 141 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 USP34Q70CQ2 3546 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A0MRY4 1105 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ANTXRLA6NF34 631 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MEI4A8MW99 385 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QYT0 321 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 STK25O00506 426 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TPP1O14773 563 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf40Q86WS4 652 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ICA1LQ8NDH6 482 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PYDC1Q8WXC3 89 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ISL2Q96A47 359 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PLD4Q96BZ4 506 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MYEOVQ96EZ4 313 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA13Q96N96 652 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB11Q96P15 392 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SORT1Q99523 831 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ANLNQ9NQW6 1124 aa26.44■■□□□ 1.82
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