RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 GRK2P25098 689 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-FP30511 346 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC26A3P40879 764 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 GRIA4P48058 902 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKAA2P54646 552 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB10P61026 200 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 NTHL1P78549 312 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OCRLQ01968 901 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNC3Q14003 757 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 RETREG3Q86VR2 466 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM25Q86YD3 366 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CCT6BQ92526 530 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOC2Q96KP1 924 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF12Q99081 682 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OMDQ99983 421 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TLE6Q9H808 572 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 THAP1Q9NVV9 213 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 COPG2Q9UBF2 871 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO10Q9UK96 956 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ACOT9Q9Y305 439 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 KCTD3Q9Y597 815 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL5AQ9Y689 179 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PQ67 120 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 K7ERQ8 282 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 HAUS5O94927 633 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 IGSF6O95976 241 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINE1P05121 402 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PDHA1P08559 390 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CPA3P15088 417 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 STMN1P16949 149 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CEBPBP17676 345 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TAS2R39P59534 338 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TMPRSS15P98073 1019 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 BCL2L1Q07817 233 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 BST1Q10588 318 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 DLG2Q15700 870 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB30Q15771 203 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MBLAC2Q68D91 279 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 C16orf46Q6P387 395 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF135Q8IUD6 432 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC63Q8NA47 563 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4L1Q8NH43 312 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms