RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 ERCC2P18074 760 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CLCN2P51788 898 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 RELAQ04206 551 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 STX5Q13190 355 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 INPP5AQ14642 412 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NR1D2Q14995 579 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ADRM1Q16186 407 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF597Q96LX8 424 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 RNF208Q9H0X6 261 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CROTQ9UKG9 612 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 TIMM44O43615 452 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 B3GAT3O94766 335 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 ATP6V1B2P21281 511 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 OR1G1P47890 313 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TAS2R39P59534 338 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EDEM1Q92611 657 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MAML3Q96JK9 1138 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 COG8Q96MW5 612 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 GPR20Q99678 358 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.98□□□□□ -1.29
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