RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SMTN-222	ENST00000612341	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SMTN-222	ENST00000612341	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SMTN-222	ENST00000612341	ARL5A	Q9Y689	179 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SMTN-222	ENST00000612341	COL6A2	P12110	1019 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CSRP3	P50461	194 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FBXL22	Q6P050	247 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KLC3	Q6P597	504 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CUZD1	Q86UP6	607 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	VWA7	Q9Y334	891 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PPP6C	O00743	305 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TADA2A	O75478	443 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF33A	Q06730	810 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO32	Q969P5	355 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SEMA3C	Q99985	751 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CENPO	Q9BU64	300 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KPNA6	O60684	536 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PEX11B	O96011	259 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UQCRB	P14927	111 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	OR1E1	P30953	314 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	HOXC13	P31276	330 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ARTN	Q5T4W7	220 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	VCX3B	Q9H321	246 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341		A0A087X1B8	175 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ETS2	P15036	469 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FOLH1	Q04609	750 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PRKCZ	Q05513	592 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GSTA3	Q16772	222 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PGBD5	Q8N414	524 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CNDP1	Q96KN2	507 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UBD	O15205	165 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CSPG5	O95196	566 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PGM3	O95394	542 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ME2	P23368	584 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SOX11	P35716	441 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TAF10	Q12962	218 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	DSC3	Q14574	896 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PIGG	Q5H8A4	983 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SMIM14	Q96QK8	99 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34

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