RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 IER2Q9BTL4 223 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 CDH19Q9H159 772 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 EBF3Q9H4W6 596 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 KCNK12Q9HB15 430 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PDFQ9HBH1 243 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NT5MQ9NPB1 228 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RAD18Q9NS91 495 aa7.4□□□□□ -1.22
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SMAD4-210ENST00000590061 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.4□□□□□ -1.22
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SMAD4-210ENST00000590061 F8W8V4 182 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 J3KR12 359 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 CRTAMO95727 393 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NDST3O95803 873 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 POLBP06746 335 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.235e-7■■□□□ 14.3
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SMAD4-210ENST00000590061 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM193AP78312 1265 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 ACCSLQ4AC99 568 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 WNT16Q9UBV4 365 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 A0A0C4DFX4 3053 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMAD4-210ENST00000590061 C2orf81A6NN90 581 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 WASH3PC4AMC7 463 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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