RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	KL	Q9UEF7	1012 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	WDR92	Q96MX6	357 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	GULP1	Q9UBP9	304 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	PADI4	Q9UM07	663 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-225	ENST00000585084	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SERPING1	P05155	500 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	RARA	P10276	462 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TCF4	P15884	667 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	LSS	P48449	732 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	RALGDS	Q12967	914 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PERM1	Q5SV97	790 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	LIPI	Q6XZB0	460 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	DPPA4	Q7L190	304 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	GKN2	Q86XP6	184 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	BBS5	Q8N3I7	341 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	WDR48	Q8TAF3	677 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	IQCD	Q96DY2	449 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	THAP2	Q9H0W7	228 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TCEA3	O75764	348 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TNF	P01375	233 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SERPINB6	P35237	376 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ZBED6	P86452	979 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TCEA2	Q15560	299 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NFKBIB	Q15653	356 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TEKT4	Q8WW24	435 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	RP1	P56715	2156 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084		A0A1W2PQ67	120 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084		A8MX80	341 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PBX1	P40424	430 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ARL10	Q8N8L6	244 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	LGMN	Q99538	433 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NUP85	Q9BW27	656 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	GPR34	Q9UPC5	381 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	KEL	P23276	732 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NFKBIA	P25963	317 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	KRT81	Q14533	505 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ACOX1	Q15067	660 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	BTBD6	Q96KE9	485 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA1024L	P59773	190 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SATB2	Q9UPW6	733 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084		A0A087X0T9	212 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	MYO1F	O00160	1098 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	MAFK	O60675	156 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-225	ENST00000585084	SOCS5	O75159	536 aa		28.58	■■■□□ 2.17

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