RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NT5MQ9NPB1 228 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 UGT2B4P06133 528 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 NUDT1P36639 197 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 C21orf59P57076 290 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 MAXP61244 160 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 ARRDC3Q96B67 414 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.96□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.95□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 WNT9AO14904 365 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 AREL1O15033 823 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 LATO43561 262 aa9.95□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 CD38P28907 300 aa9.95□□□□□ -0.82
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 P3H1Q32P28 736 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 TRIM69Q86WT6 500 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 ZNF567Q8N184 647 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 SKA1Q96BD8 255 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 SERAC1Q96JX3 654 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 FCRL5Q96RD9 977 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-209ENST00000580646 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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