RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ERCC2P18074 760 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PBX1P40424 430 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 XKR6Q5GH73 641 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PROSER1Q86XN7 944 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 YDJCA8MPS7 323 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD11O00231 422 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 IL31RAQ8NI17 732 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 KPNA5O15131 536 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 IDO1P14902 403 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 MATKP42679 507 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 BNC1Q01954 994 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SSNA1O43805 119 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 BPGMP07738 259 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A3P40879 764 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SPIBQ01892 262 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 VGLL4Q14135 290 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GPAT3Q53EU6 434 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 RNF44Q7L0R7 432 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GPR156Q8NFN8 814 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PIGUQ9H490 435 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 B4GALT5O43286 388 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PYDC2Q56P42 97 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CXCR2P25025 360 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CLYBLQ8N0X4 340 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PARP8Q8N3A8 854 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 OR4L1Q8NH43 312 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CD101Q93033 1021 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 LINGO1Q96FE5 620 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CITED4Q96RK1 184 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ABCG8Q9H221 673 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRG6 482 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PRKG2Q13237 762 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ARSHQ5FYA8 562 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SUN5Q8TC36 379 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ITCHQ96J02 903 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRB2O60241 1585 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 MAPKAPK2P49137 400 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CBX3Q13185 183 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TAF13Q15543 124 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CNSTQ6PJW8 725 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 LPPQ93052 612 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 WNT7AO00755 349 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 FGRP09769 529 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0D1P61421 351 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 COPZ1P61923 177 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 LPIN1Q14693 890 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SUSD6Q92537 303 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC10Q969S8 669 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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