RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 GCATO75600 419 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PCCBP05166 539 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SKILP12757 684 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ITIH2P19823 946 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CDH6P55285 790 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZBED6P86452 979 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf61Q13536 156 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PEX6Q13608 980 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DPYSQ14117 519 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SPIDRQ14159 915 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KRT81Q14533 505 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IQCB1Q15051 598 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NFKBIBQ15653 356 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ISXQ2M1V0 245 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GUSBP11Q6P575 273 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARL14Q8N4G2 192 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SPOCK2Q92563 424 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HSPH1Q92598 858 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 U3KQA8 63 aa16.7■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TNFRSF10CO14798 259 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1024LP59773 190 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 FANCCQ00597 558 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ACOX1Q15067 660 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MARC1Q5VT66 337 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DPPA4Q7L190 304 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 WDR26Q9H7D7 661 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GULP1Q9UBP9 304 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GPR34Q9UPC5 381 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR1A2Q9Y585 309 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ATRXP46100 2492 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MPOP05164 745 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MYF5P13349 255 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TGM2P21980 687 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CES1P23141 567 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ALG11Q2TAA5 492 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LIPIQ6XZB0 460 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NPWQ8N729 165 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DPH1Q9BZG8 443 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM7Q9C029 511 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 STRADBQ9C0K7 418 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SYCE3A1L190 88 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TK2O00142 265 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PSMD11O00231 422 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RARAP10276 462 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CA4P22748 312 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RGRP47804 291 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF7Q14155 803 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 USP45Q70EL2 814 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms