RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ELFN1	P0C7U0	828 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TSHR	P16473	764 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CR2	P20023	1033 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NFKBIA	P25963	317 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GJC1	P36383	396 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MMP13	P45452	471 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RPIA	P49247	311 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSE	P51690	589 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HK3	P52790	923 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAX	P61244	160 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ITK	Q08881	620 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RALGDS	Q12967	914 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MTM1	Q13496	603 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DPYSL3	Q14195	570 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NFATC4	Q14934	902 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RTP5	Q14D33	572 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOX1	Q15067	660 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ELOC	Q15369	112 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NR0B2	Q15466	257 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CDKN3	Q16667	212 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DPPA4	Q7L190	304 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HID1	Q8IV36	788 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	VSTM4	Q8IW00	320 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PGBD5	Q8N414	524 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	IFI44	Q8TCB0	444 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC42	Q96M95	316 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MGME1	Q9BQP7	344 aa		9.44	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	CLPB	Q9H078	707 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NOD2	Q9HC29	1040 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479		U3KQA8	63 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	USP24	Q9UPU5	2620 aa		9.44	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MATN3	O15232	486 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM253	P0C7T8	217 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	KEL	P23276	732 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNC	P24863	283 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	ALG11	Q2TAA5	492 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PNCK	Q6P2M8	343 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GUSBP11	Q6P575	273 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
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KIFC3-231	ENST00000567479	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX26	Q8N6G2	289 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF214	Q8ND24	703 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK15	Q8TD08	544 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SPOCK2	Q92563	424 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR92	Q96MX6	357 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CHP1	Q99653	195 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF670	Q9BS34	389 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC61	Q9BV99	259 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	BOC	Q9BWV1	1114 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NT5M	Q9NPB1	228 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GULP1	Q9UBP9	304 aa		9.43	□□□□□ -0.9

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