RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 RXRGP48443 463 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MARCKSL1P49006 195 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 LIG3P49916 1009 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 THOP1P52888 689 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 KLK6Q92876 244 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 VOPP1Q96AW1 172 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 SCRN2Q96FV2 425 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HES6Q96HZ4 224 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC6Q99741 560 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ITM2BQ9Y287 266 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 H7C0C1 242 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TM4SF5O14894 197 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 KELP23276 732 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HTR1BP28222 390 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP5OP48047 213 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CCZ1BP86790 482 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAF2Q12933 501 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NOMO1Q15155 1222 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NPNTQ6UXI9 565 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NAXDQ8IW45 347 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TEKT5Q96M29 485 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 KNL1Q8NG31 2342 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 SPINT1O43278 529 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 FTCDO95954 541 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 WNT1P04628 370 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGAVP06756 1048 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CD86P42081 329 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 BLKP51451 505 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 BNC1Q01954 994 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 DSC2Q02487 901 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB17Q13105 803 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MTM1Q13496 603 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ACOX1Q15067 660 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS6KA1Q15418 735 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 LIPIQ6XZB0 460 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 Q6ZSR6 202 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PARGQ86W56 976 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CENPTQ96BT3 561 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 AGAP3Q96P47 875 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOCQ99972 504 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 FZD3Q9NPG1 666 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 GGT7Q9UJ14 662 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0J9YYE9 177 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NEMP2A6NFY4 417 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 H0Y8X5 98 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 FZD6O60353 706 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNK5O95279 499 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBC1P01850 177 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ALPPL2P10696 532 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PYGMP11217 842 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPN3P26045 913 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPSAP1Q14558 356 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 PPM1JQ5JR12 505 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTA-205ENST00000558534 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms