RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	IL25	Q9H293	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	IKBKB	O14920	756 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CHAT	P28329	748 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ELF1	P32519	619 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NEDD9	Q14511	834 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NFATC4	Q14934	902 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MEIS3	Q99687	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A1W2PPH5	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591		J3KRW8	73 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	WNT9B	O14905	357 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CYC1	P08574	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	G6PD	P11413	515 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PAX3	P23760	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CCKBR	P32239	447 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ICAM3	P32942	547 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SORD	Q00796	357 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MYBPH	Q13203	477 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	KEAP1	Q14145	624 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	GSTA3	Q16772	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CSF3R	Q99062	836 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	GPT	P24298	496 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	KRT9	P35527	623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RGS2	P41220	211 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	GABRB2	P47870	512 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CCR9	P51686	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TUBA1B	P68363	451 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	MPP1	Q00013	466 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	RND1	Q92730	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CFAP54-208	ENST00000556591	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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