RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555082.5

PRKCH-211, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCH, Length 2,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-211ENST00000555082 LGMNQ99538 433 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 GKN1Q9NS71 199 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MKS1Q9NXB0 559 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MPP6Q9NZW5 540 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DMTF1Q9Y222 760 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 INSL5Q9Y5Q6 135 aa10□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 C5orf42Q9H799 3197 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 AP1G1O43747 822 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 GLRA3O75311 464 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TNFAIP8O95379 198 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CPA3P15088 417 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ERCC2P18074 760 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 PIK3R1P27986 724 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SERPINB9P50453 376 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CDH15P55291 814 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DLG2Q15700 870 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 KLHL35Q6PF15 583 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DSELQ8IZU8 1212 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 NPWQ8N729 165 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SLC22A12Q96S37 553 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DTLQ9NZJ0 730 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RFPL2O75678 378 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CHRNGP07510 517 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TFPTP0C1Z6 253 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SAT1P21673 171 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MPSTP25325 297 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SERPINB8P50452 374 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TBX4P57082 545 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TPI1P60174 286 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SMARCB1Q12824 385 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CEACAM7Q14002 265 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 PPP2R5DQ14738 602 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DBN1Q16643 649 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ATP2A3Q93084 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CCT7Q99832 543 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RNF38Q9H0F5 515 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 COPG2Q9UBF2 871 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.99□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 F9P00740 461 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 IRF1P10914 325 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 FUT4P22083 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CCR1P32246 355 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DPP6P42658 865 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 IRF9Q00978 393 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SEMA3BQ13214 749 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 NTAN1Q96AB6 310 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RTKNQ9BST9 563 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 NACA2Q9H009 215 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CCDC78A2IDD5 438 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CCL16O15467 120 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 CYP4F8P98187 520 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 DPYSQ14117 519 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 FSCBQ5H9T9 825 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 ARTNQ5T4W7 220 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TPGS2Q68CL5 300 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 TXNDC8Q6A555 127 aa9.98□□□□□ -0.81
PRKCH-211ENST00000555082 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms