RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 PIGVQ9NUD9 493 aa23.64■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 MTORP42345 2549 aa23.64■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZW10O43264 779 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 YEATS4O95619 227 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 DLSTP36957 453 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ACVRL1P37023 503 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 MC2RQ01718 297 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 GNA12Q03113 381 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 MTA1Q13330 715 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 LRRC31Q6UY01 552 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 NT5C1BQ96P26 610 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 NAV3Q8IVL0 2385 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PPM1DO15297 605 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SRGAP2O75044 1071 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 DLGAP3O95886 979 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 BMP6P22004 513 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 MTM1Q13496 603 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CUL4AQ13619 759 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ARTNQ5T4W7 220 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 RRAGAQ7L523 313 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 DRC7Q8IY82 874 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 C5orf34Q96MH7 638 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 WDCPQ9H6R7 721 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CETN3O15182 167 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 GSRP00390 522 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 GPR3P46089 330 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM71Q6P5X7 295 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 NRROSQ86YC3 692 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SLC34A3Q8N130 599 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 NETO2Q8NC67 525 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PCNX1Q96RV3 2341 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 HSF2BPO75031 334 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 KATNA1O75449 491 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CCNB1P14635 433 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1024LP59773 190 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PDCLQ13371 301 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 LGR4Q9BXB1 951 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TAAR2Q9P1P5 351 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CROTQ9UKG9 612 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SLC5A6Q9Y289 635 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 AKAP9Q99996 3911 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 RHOBTB3O94955 611 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 GLI1P08151 1106 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 AK4P27144 223 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ME1P48163 572 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 LIG3P49916 1009 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 PGDP52209 483 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SQSTM1Q13501 440 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ESX1Q8N693 406 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TTC13Q8NBP0 860 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 SVILO95425 2214 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 MAN1A1P33908 653 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ELP6Q0PNE2 266 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 HMCESQ96FZ2 354 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CPXM1Q96SM3 734 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ZPBPQ9BS86 351 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 TWSG1Q9GZX9 223 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ACP6Q9NPH0 428 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO8Q9NRD0 319 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 RRN3Q9NYV6 651 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC168Q8NDH2 2452 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 PRSS38A1L453 326 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 TNFRSF10CO14798 259 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 CXCR3P49682 368 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 NR6A1Q15406 480 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-202ENST00000547188 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.57■■□□□ 1.36
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