RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDXDC1Q6P996 788 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCTLQ6UWM7 567 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOXA1Q86UR1 476 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 AADATQ8N5Z0 425 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF570Q96NI8 536 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 MKLN1Q9UL63 735 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYO6Q9UM54 1294 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 VNN2O95498 520 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACADMP11310 421 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARRB2P32121 409 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABATP80404 500 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT24Q2M2I5 525 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALG11Q2TAA5 492 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP41Q3LFD5 358 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGO1Q5FBB7 561 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TSSK4Q6SA08 328 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHFQ7M4L6 423 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FRMD1Q8N878 549 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASB5Q8WWX0 329 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TIGD1Q96MW7 591 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRFN5Q96NI6 719 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSAT1Q9Y617 370 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM202A6NGA9 273 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBED4O75132 1171 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT10P13645 584 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 NFKBIAP25963 317 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 MLH1P40692 756 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 DLK2Q6UY11 383 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBTB2Q8N680 514 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ERGIC1Q969X5 290 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABI3Q9P2A4 366 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 LIPT2A6NK58 231 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 SNAP23O00161 211 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 TIMM23O14925 209 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 GLUD1P00367 558 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 LMO1P25800 156 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 PBX3P40426 434 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 GLUD2P49448 558 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 MXI1P50539 228 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00205P59089 165 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 EGR4Q05215 589 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 SARM1Q6SZW1 724 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 WDR63Q8IWG1 891 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDILTQ8N807 584 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms