RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PQLC3Q8N755 202 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FBXO27Q8NI29 283 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CXorf38Q8TB03 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DDI1Q8WTU0 396 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ING5Q8WYH8 240 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CDKL2Q92772 493 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DLG3Q92796 817 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM143Q96AN5 459 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP36Q96G28 342 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM84AQ96KN4 292 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PEBP4Q96S96 227 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NDNQ99608 321 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FZD8Q9H461 694 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ASB7Q9H672 318 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MID2Q9UJV3 735 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EMCNQ9ULC0 261 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 INVSQ9Y283 1065 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SQORQ9Y6N5 450 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.29□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 H3BNX3 289 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TEX28O15482 410 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KCNN4O15554 427 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRKCBP05771 671 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 APOA4P06727 396 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TGFB3P10600 412 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CD19P15391 556 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VAV1P15498 845 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PGAM1P18669 254 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MX2P20592 715 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ITGAXP20702 1163 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HADHAP40939 763 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CPA2P48052 419 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC1A6P48664 564 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IDH3AP50213 366 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KDSRQ06136 332 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SEMA3BQ13214 749 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KRT81Q14533 505 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PDK3Q15120 406 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DPYSL2Q16555 572 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SFT2D3Q587I9 215 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EPGNQ6UW88 154 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PACS1Q6VY07 963 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RAPH1Q70E73 1250 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RDH11Q8TC12 318 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF217Q8TC41 542 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HSPH1Q92598 858 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF778Q96MU6 729 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms