RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HSPB6	O14558	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SERPINC1	P01008	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CYP1A2	P05177	515 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CHRM4	P08173	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HOXB2	P14652	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	GPD2	P43304	727 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MAGEA9	P43362	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PTPN9	P43378	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MAPK9	P45984	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	GPR12	P47775	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	GPR18	Q14330	331 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RPE65	Q16518	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331		Q6ZTK2	550 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HSPH1	Q92598	858 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MROH8	Q9H579	483 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CHD4	Q14839	1912 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331		A0A096LPK6	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NCAM2	O15394	837 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	INSIG1	O15503	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NTN1	O95631	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ADA	P00813	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PGM1	P36871	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RFX2	P48378	723 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CDH12	P55289	794 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SELENOV	P59797	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ZP1	P60852	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	VAMP2	P63027	116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	GPS2	Q13227	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	DUSP6	Q16828	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GFM2-208	ENST00000513331	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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