RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC10BA6NIK2 292 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 GM2AP17900 193 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SLC5A2P31639 672 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM23P36406 574 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 COPB1P53618 953 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 INHBCP55103 352 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G15Q8NCC3 412 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TNFP01375 233 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TPM2P07951 284 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 CERCAMQ5T4B2 595 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 MCOLN2Q8IZK6 566 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 OR1E3Q8WZA6 343 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SPOCK2Q92563 424 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM74Q96NL1 305 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ERGIC2Q96RQ1 377 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SYT11Q9BT88 431 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SLC39A8Q9C0K1 460 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 STRADBQ9C0K7 418 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 EPB41L5Q9HCM4 733 aa30.36■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD62A6NC57 917 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM202A6NGA9 273 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 LGALS16A8MUM7 142 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TNFRSF10CO14798 259 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 NVLO15381 856 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 GLB1P16278 677 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TPI1P60174 286 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ACAD10Q6JQN1 1059 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 LIPIQ6XZB0 460 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 RD3Q7Z3Z2 195 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SRLQ86TD4 932 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 NEK11Q8NG66 645 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 FOXP3Q9BZS1 431 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 FGF22Q9HCT0 170 aa30.35■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 PRKCGP05129 697 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 PCCBP05166 539 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 CLEC17AQ6ZS10 378 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 CCNJLQ8IV13 435 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 OR56A4Q8NGH8 313 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 NSMCE3Q96MG7 304 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa30.34■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 SERPINA4P29622 427 aa30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TCEA2Q15560 299 aa30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM159Q96B96 161 aa30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP42A6NI28 874 aa30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 CA9Q16790 459 aa30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 DPPA4Q7L190 304 aa30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 AP4E1Q9UPM8 1137 aa30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 HGFP14210 728 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 MAMLD1Q13495 774 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP58Q5T655 872 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 DCUN1D2Q6PH85 259 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 SPRED1Q7Z699 444 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 SLITRK4Q8IW52 837 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 SFTPA2Q8IWL1 248 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 PALMO75781 387 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 KELP23276 732 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 LINC00303Q3SY05 128 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 C14orf28Q4W4Y0 310 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 XKR5Q6UX68 686 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 EXD3Q8N9H8 876 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 PEBP4Q96S96 227 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM168Q9H0V1 697 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 LMBRD1Q9NUN5 540 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 LOXL2Q9Y4K0 774 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 RNF215Q9Y6U7 377 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 SPTA1P02549 2419 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
ALYREF-202ENST00000505490 ELFN1P0C7U0 828 aa30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms