RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496840.1

TARDBP-210, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene TARDBP, Length 692 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-210ENST00000496840 MDFICQ9P1T7 246 aa5.98□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 HSF4Q9ULV5 492 aa5.98□□□□□ -1.45
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TARDBP-210ENST00000496840 NDUFS7O75251 213 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 RFPL2O75678 378 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 URODP06132 367 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 UMODP07911 640 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 ETFAP13804 333 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 AGAP20933 346 aa5.97□□□□□ -1.45
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TARDBP-210ENST00000496840 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.97□□□□□ -1.45
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TARDBP-210ENST00000496840 SPATA20Q8TB22 786 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 TANKQ92844 425 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 NOX4Q9NPH5 578 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.97□□□□□ -1.45
TARDBP-210ENST00000496840 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 TAF4O00268 1085 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 GRID2O43424 1007 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MMP2P08253 660 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 AMD1P17707 334 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 DGKAP23743 735 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 POU1F1P28069 291 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 RAD23BP54727 409 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 CDH15P55291 814 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 TLE2Q04725 743 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 VEPH1Q14D04 833 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 NFIL3Q16649 462 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 NOXA1Q86UR1 476 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 C3orf30Q96M34 536 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 CSF3RQ99062 836 aa5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 GALTP07902 379 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 EDN2P20800 178 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MTSS1LQ765P7 747 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 SMIM29Q86T20 159 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 BEST2Q8NFU1 509 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF570Q96NI8 536 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 NODALQ96S42 347 aa5.95□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 NUF2Q9BZD4 464 aa5.95□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.95□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MCM3P25205 808 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 CCT5P48643 541 aa5.94□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 ARL16Q0P5N6 197 aa5.94□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 TCTN1Q2MV58 587 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 SGO1Q5FBB7 561 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 TXNDC8Q6A555 127 aa5.94□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 NEK9Q8TD19 979 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 FIG4Q92562 907 aa5.94□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 C1RLQ9NZP8 487 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.94□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 PRSS47A8MTI9 375 aa5.93□□□□□ -1.46
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TARDBP-210ENST00000496840 EFNA5P52803 228 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 NLRP5P59047 1200 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 TAF12Q16514 161 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MMEL1Q495T6 779 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 SLC22A25Q6T423 547 aa5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TARDBP-210ENST00000496840 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.93□□□□□ -1.46
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