RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	ART4	Q93070	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SCRN2	Q96FV2	425 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	LYSMD1	Q96S90	227 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	BFAR	Q9NZS9	450 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SARDH	Q9UL12	918 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TRIO	O75962	3097 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711		A0A0J9YYE9	177 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MAGEB16	A2A368	324 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MID1	O15344	667 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TSPAN6	O43657	245 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PI15	O43692	258 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TRBC1	P01850	177 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ADRB3	P13945	408 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TIMP2	P16035	220 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF30	P17039	623 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NDUFV2	P19404	249 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	P2RY2	P41231	377 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CBLB	Q13191	982 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	IHH	Q14623	411 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	QPCT	Q16769	361 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	VOPP1	Q96AW1	172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ARRDC3	Q96B67	414 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	IL22	Q9GZX6	179 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	GDF3	Q9NR23	364 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711		H0Y858	1186 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CRTAM	O95727	393 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PDHA1	P08559	390 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TNFRSF8	P28908	595 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PTPN5	P54829	565 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PLTP	P55058	493 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CNTN1	Q12860	1018 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	HIF1A	Q16665	826 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	ANO7	Q6IWH7	933 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NAT9	Q9BTE0	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	HEATR9	A2RTY3	570 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	C2orf81	A6NN90	581 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	PSMD11	O00231	422 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	NEMP1	O14524	444 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	AREL1	O15033	823 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	AXIN1	O15169	862 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	USP12	O75317	370 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM63A	O94886	807 aa		12.47	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms