RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-213ENST00000490332 KCNK13Q9HB14 408 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MRGBPQ9NV56 204 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ZFATQ9P243 1243 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FNIP2Q9P278 1114 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GGT7Q9UJ14 662 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MCM8Q9UJA3 840 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 KLK13Q9UKR3 277 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 RNF114Q9Y508 228 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 LRRC42Q9Y546 428 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 POLQO75417 2590 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TSC2P49815 1807 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 LRRK2Q5S007 2527 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 WDR27A2RRH5 827 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FAM170BA6NMN3 283 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TMEM114B3SHH9 223 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FCHO1O14526 889 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 DCLK1O15075 740 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CREB3O43889 395 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CIB2O75838 187 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ANXA9O76027 345 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FGF18O76093 207 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 USP1O94782 785 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 AP2A1O95782 977 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 LTFP02788 710 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MYL2P10916 166 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ODC1P11926 461 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GP1BBP13224 206 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TDGF1P13385 188 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ERCC2P18074 760 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CCNCP24863 283 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TYK2P29597 1187 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PRDX6P30041 224 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ELF1P32519 619 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CXCR3P49682 368 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 SERPINB8P50452 374 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CSRP3P50461 194 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CCR3P51677 355 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 RAP1GDS1P52306 607 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TPI1P60174 286 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ERVFC1P60507 584 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CFHR1Q03591 330 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ADIGQ0VDE8 80 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 BST1Q10588 318 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 SEMA3BQ13214 749 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MTA1Q13330 715 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 SERINC3Q13530 473 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 DPYSQ14117 519 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CRYMQ14894 314 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TEAD4Q15561 434 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CHI3L2Q15782 390 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TEX44Q53QW1 395 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 RAB6CQ53S08 254 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FSCBQ5H9T9 825 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 MROH9Q5TGP6 573 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 WSCD1Q658N2 575 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PACS1Q6VY07 963 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF534Q76KX8 674 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 TMEM135Q86UB9 458 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 SERINC5Q86VE9 423 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 OSTM1Q86WC4 334 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 FAM131BQ86XD5 332 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 KIRREL3Q8IZU9 778 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 ZNF567Q8N184 647 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-213ENST00000490332 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms