RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	FAM170A	A1A519	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	MMP20	O60882	483 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	RASGRP1	O95267	797 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	ERBB2	P04626	1255 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	LIF	P15018	202 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	NKD1	Q969G9	470 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	EPAS1	Q99814	870 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM3-208	ENST00000489344	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18	3e-20	■□□□□ 11.1
RBM3-208	ENST00000489344	TOR1B	O14657	336 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	HSF2BP	O75031	334 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TM7SF2	O76062	418 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	UGT2B4	P06133	528 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GLI1	P08151	1106 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GZMA	P12544	262 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CCL4	P13236	92 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MMP8	P22894	467 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	OR1E1	P30953	314 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	IRF4	Q15306	451 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	KRIT1	O00522	736 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	MTSS1	O43312	755 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	GLB1	P16278	677 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ARF5	P84085	180 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	CHP1	Q99653	195 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	LRBA	P50851	2863 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RBM3-208	ENST00000489344	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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