RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	PTK2	Q05397	1052 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	NR1D2	Q14995	579 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	FAM131B	Q86XD5	332 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	SHC3	Q92529	594 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	HMCES	Q96FZ2	354 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	FGF22	Q9HCT0	170 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	DNAI1	Q9UI46	699 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		10.65	□□□□□ -0.7
APTX-222	ENST00000478279	ESPL1	Q14674	2120 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BUB1	O43683	1085 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KDELR3	O43731	214 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RAMP2	O60895	175 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FLT3	P36888	993 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R2	P41236	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GPR3	P46089	330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GABRB2	P47870	512 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MLLT10	P55197	1068 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RHOA	P61586	193 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CDC20	Q12834	499 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SQSTM1	Q13501	440 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SEPT6	Q14141	434 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	UGP2	Q16851	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ERAP2	Q6P179	960 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SPRY4	Q9C004	299 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.64	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TSPAN11	A1L157	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CFAP69	A5D8W1	941 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	INSIG1	O15503	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	AGFG2	O95081	481 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FGF1	P05230	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KRT7	P08729	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CCNB1	P14635	433 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SLC9A1	P19634	815 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TRIM23	P36406	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MMP12	P39900	470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	STAT1	P42224	750 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RAB15	P59190	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MC1R	Q01726	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ANKS6	Q68DC2	871 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	EFCAB7	A8K855	629 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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