RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	HLA-B	Q31612	363 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	FYB2	Q5VWT5	728 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf74	Q96LT6	269 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	IL21R	Q9HBE5	538 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUBCN-208	ENST00000471364	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364		F5H423	210 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	AVIL	O75366	819 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	APRT	P07741	180 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMB4	P28070	264 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SSTR1	P30872	391 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GNGT1	P63211	74 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF234	Q14588	700 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PARP6	Q2NL67	630 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC38	Q502W7	563 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PALM2	Q8IXS6	379 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SNX19	Q92543	992 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LAMA5	O15230	3695 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNK1	O00180	336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MTSS1	O43312	755 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TIMM44	O43615	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	KLKB1	P03952	638 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EPHX1	P07099	455 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	HMBS	P08397	361 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PHB	P35232	272 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MAGEA3	P43357	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	COPA	P53621	1224 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	BNC1	Q01954	994 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBTB17	Q13105	803 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TEAD4	Q15561	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	AFMID	Q63HM1	303 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP4X1	Q8N118	509 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CIPC	Q9C0C6	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MPP6	Q9NZW5	540 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	KNL1	Q8NG31	2342 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	APC2	O95996	2303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1B0GVT2	93 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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