RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-208ENST00000471202 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 A0A0J9YYE9 177 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 AHCYL1O43865 530 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CTPS1P17812 591 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 FAM187BQ17R55 369 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC103Q8IW40 242 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TCF12Q99081 682 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 E9PAM4 449 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 NFKBIEO00221 500 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 IDO1P14902 403 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 XIAPP98170 497 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 BNIP2Q12982 314 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 FIZ1Q96SL8 496 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 GSTM1P09488 218 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CYP3A5P20815 502 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 MC4RP32245 332 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 GPR15P49685 360 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SLC16A1P53985 500 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DSC2Q02487 901 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TNK2Q07912 1038 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DUSP4Q13115 394 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 BLMHQ13867 455 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TTC23Q5W5X9 447 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TMEM110Q86TL2 294 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TEKT5Q96M29 485 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 APOL4Q9BPW4 351 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SELENONQ9NZV5 590 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 STK25O00506 426 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TIPRLO75663 272 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 NOVP48745 357 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 IDH3AP50213 366 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 INHBEP58166 350 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TAS2R39P59534 338 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 USP45Q70EL2 814 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 GMIPQ9P107 970 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SLC18A1P54219 525 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DGCR6Q14129 220 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF460Q14592 562 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CIB1Q99828 191 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 KRT84Q9NSB2 600 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 DPPA5A6NC42 116 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ABLIM1O14639 778 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TBL1XO60907 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CATP04040 527 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 COX7A2P14406 83 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 MTX3Q5HYI7 312 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 USE1Q9NZ43 259 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.54□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PPEF2O14830 753 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 EPN2O95208 641 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 OTCP00480 354 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 LYNP07948 512 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 ANXA6P08133 673 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 VCLP18206 1134 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.53□□□□□ -0.08
CHTF18-208ENST00000471202 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms