RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 IL23AQ9NPF7 189 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 HEY2Q9UBP5 337 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A087X1B8 175 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC162PA2VCL2 907 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 H7C0S8 307 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 GRID2O43424 1007 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 TRIM13O60858 407 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 RHOCP08134 193 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 GM2AP17900 193 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 IDH3AP50213 366 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 EPHB3P54753 998 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 AQP5P55064 265 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN2DP55273 166 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A1Q13621 1099 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CDKN3Q16667 212 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MPP7Q5T2T1 576 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 EPGNQ6UW88 154 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MAPK15Q8TD08 544 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CALML6Q8TD86 181 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 EID2BQ96D98 161 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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