RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 PARGQ86W56 976 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 EID2Q8N6I1 236 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 EXD1Q8NHP7 514 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 SAP25Q8TEE9 199 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 P3H4Q92791 437 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.59■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 AMFRQ9UKV5 643 aa20.59■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 PJA2O43164 708 aa20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 ALPPL2P10696 532 aa20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 CTNNA2P26232 953 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 MARCKSL1P49006 195 aa20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 PEX26Q7Z412 305 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM139Q8IV31 216 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAF8-204ENST00000461219 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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SCAF8-204ENST00000461219 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 RWDD2BP57060 319 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 COPS2P61201 443 aa20.57■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 AGAP3Q96P47 875 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CEP41Q9BYV8 373 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CHKBQ9Y259 395 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.56■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 PMLP29590 882 aa20.56■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 NUS1Q96E22 293 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 OLFM3Q96PB7 478 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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