RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL2L1Q07817 233 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC3Q13217 504 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC14A1Q13336 389 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FZD2Q14332 565 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF235Q14590 738 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 MARC1Q5VT66 337 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC38Q5VT99 294 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RFX6Q8HWS3 928 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A45Q8N413 288 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB12Q8WXK4 309 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 OLFM3Q96PB7 478 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IL12RB2Q99665 862 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA3CQ99985 751 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CHKBQ9Y259 395 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF487B1APH4 448 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 K7ESM1 405 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM38O00635 465 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NEMP1O14524 444 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 APOL1O14791 398 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAMP1O15126 338 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PSTPIP1O43586 416 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPOPO43791 374 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA12O60330 932 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CST8O60676 142 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NEBLO76041 1014 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DKK1O94907 266 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PGLSO95336 258 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FUCA1P04066 466 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNB1P14635 433 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DGKAP23743 735 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA4P29622 427 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT1P36639 197 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCT8P50990 548 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RENBPP51606 427 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SKOR1P84550 965 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ITKQ08881 620 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXC1Q12948 553 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF4Q15306 451 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPA17Q15506 151 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CNGA3Q16281 694 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN3Q16667 212 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DPPA4Q7L190 304 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCHQ86VS3 1027 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RBFAQ8N0V3 343 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 EID2Q8N6I1 236 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNYQ8ND76 341 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG3Q92685 438 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TADA1Q96BN2 335 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 HAUS1Q96CS2 278 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR24Q96S15 920 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LGR4Q9BXB1 951 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms