RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CRATP43155 626 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CDC42P60953 191 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GRM3Q14832 879 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OOSP2Q86WS3 158 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CDK20Q8IZL9 346 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PGBD3Q8N328 593 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MFSD3Q96ES6 412 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATA2Q9UM82 520 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 POMPQ9Y244 141 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TAF4O00268 1085 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CATP04040 527 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AKR1A1P14550 325 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BEX3Q00994 111 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SEMA5AQ13591 1074 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PLCL1Q15111 1095 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PMF1Q6P1K2 205 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR180Q86V85 440 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF781Q8N8C0 355 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYPNQ86TC9 1320 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ADM5C9JUS6 153 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 H3BNX3 289 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 STK25O00506 426 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM63AO94886 807 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AP2A1O95782 977 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FGF1P05230 155 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL4DP49703 201 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SREBF2Q12772 1141 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 COX10Q12887 443 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PEX6Q13608 980 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF846Q147U1 533 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMD5Q16401 504 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF384Q8TF68 577 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYDGFQ969H8 173 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SQORQ9Y6N5 450 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.22□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC28A1O00337 649 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SERPINA4P29622 427 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GRK4P32298 578 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL2P36404 184 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CAPZA2P47755 286 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IDH3AP50213 366 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ITIH5Q86UX2 942 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EBF3Q9H4W6 596 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C8orf4Q9NR00 106 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RIPK3Q9Y572 518 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ALDH1A2O94788 518 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PSEN1P49768 467 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2T12Q8NG77 320 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C19orf60Q96EN9 201 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TINF2Q9BSI4 451 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.21□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms