RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 PSMG2Q969U7 264 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL29Q96CT2 875 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ERP27Q96DN0 273 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 VPS39Q96JC1 886 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 FEM1CQ96JP0 617 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 APOL2Q9BQE5 337 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 WWP1Q9H0M0 922 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 NT5MQ9NPB1 228 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 KLC4Q9NSK0 619 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 COPG2Q9UBF2 871 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SEPT3Q9UH03 358 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 STOML2Q9UJZ1 356 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ASB3Q9Y575 518 aa10.11□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 A0A096LPK6 155 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0G2JND7 137 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM114B3SHH9 223 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM12O43184 909 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SLC7A4O43246 635 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 KDELR3O43731 214 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 VAPBO95292 243 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 GSRP00390 522 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 FGF1P05230 155 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 C2P06681 752 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 HMBSP08397 361 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MYL4P12829 197 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CD86P42081 329 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CD151P48509 253 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 HK2P52789 917 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 EPHB3P54753 998 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 POU4F1Q01851 419 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 GNA12Q03113 381 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF235Q14590 738 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 POU6F1Q14863 301 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ADGRF1Q5T601 910 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 NEPROQ6NW34 567 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CLNKQ7Z7G1 428 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MYADMQ96S97 322 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 AGAP2Q99490 1192 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK13Q9HB14 408 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 EMCNQ9ULC0 261 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087X1B8 175 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GVM2 712 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MROH6A6NGR9 719 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 TEX28O15482 410 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 COCHO43405 550 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MGRN1O60291 552 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 LILRB3O75022 631 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 HAUS5O94927 633 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SEC24AO95486 1093 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 C1RP00736 705 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 AHSGP02765 367 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MMP2P08253 660 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINF2P08697 491 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 RALBP11234 206 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 LAMP2P13473 410 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 PFKLP17858 780 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SLC26A3P40879 764 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 STARD6P59095 220 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 RAB10P61026 200 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ACVR1Q04771 509 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB16Q05516 673 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 DMWDQ09019 674 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.793e-7■■■□□ 16.9
POLR1A-204ENST00000424089 OVGP1Q12889 678 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-204ENST00000424089 CNGA3Q16281 694 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms