RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TREX1Q9NSU2 369 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PPM1HQ9ULR3 514 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.38■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 A0A0J9YYE9 177 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ALDH1A2O94788 518 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TRBC1P01850 177 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 GLULP15104 373 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 DRD1P21728 446 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ARNTP27540 789 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 HNF1BP35680 557 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SPANXN3Q5MJ09 141 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 FAM3CQ92520 227 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 EID2BQ96D98 161 aa23.37■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ADAM23O75077 832 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SPAG6O75602 509 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SLC4A1P02730 911 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-10P10266 1014 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CA14Q9ULX7 337 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ARSDP51689 593 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SUN2Q9UH99 717 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TLDC2A0PJX2 215 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 UGT1A9O60656 530 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 GSTA2P09210 222 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TMPRSS15P98073 1019 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CCINQ13939 588 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 STAT4Q14765 748 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CDKN3Q16667 212 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ZNF805Q5CZA5 627 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SPOCK2Q92563 424 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 UGT1A7Q9HAW7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 UGT1A10Q9HAW8 530 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 UGT1A8Q9HAW9 530 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PLK4O00444 970 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 VAPBO95292 243 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TIMP2P16035 220 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 UGP2Q16851 508 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SCRN2Q96FV2 425 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CERS2Q96G23 380 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 CYTH2Q99418 400 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 FAM159BA6NKW6 160 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 C16orf96A6NNT2 1141 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 RNF40O75150 1001 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 IL1BP01584 269 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 NTSR1P30989 418 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 STX2P32856 288 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 KRT71Q3SY84 523 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 TMIEQ8NEW7 156 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 ZNF711Q9Y462 761 aa23.34■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 A0A0C4DFX4 3053 aa23.33■■□□□ 1.33
CNN3-202ENST00000394202 MUC3AQ02505 3323 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.6 ms