RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391309.1

SNORD30.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 30, humanhuman

BASIC

Gene SNORD30, Length 70 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD30.1-201ENST00000391309 DPP9Q86TI2 863 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 SLC25A42Q86VD7 318 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 MAGEC3Q8TD91 643 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 RNF138Q8WVD3 245 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 COA7Q96BR5 231 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 RAD21L1Q9H4I0 556 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 MCM9Q9NXL9 1143 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 MYO10Q9HD67 2058 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGFBP2P18065 325 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 FAPQ12884 760 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 DRP2Q13474 957 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 LY6EQ16553 131 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SYTL3Q4VX76 610 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 DENND6AQ8IWF6 608 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 HSCBQ8IWL3 235 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 OVCA2Q8WZ82 227 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 DNAJC7Q99615 494 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 FAM83DQ9H4H8 585 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PLEKHA3Q9HB20 300 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 KRT84Q9NSB2 600 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 LMBRD1Q9NUN5 540 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 RNF186Q9NXI6 227 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SIRPGQ9P1W8 387 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 FBXO4Q9UKT5 387 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 KLHL20Q9Y2M5 609 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 MST1RQ04912 1400 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 TRIM49BA6NDI0 452 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 FAM157AC9JC47 383 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 KLF11O14901 512 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SLC22A2O15244 555 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CTSVO60911 334 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PNMTP11086 282 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 S1PR1P21453 382 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PRKCHP24723 683 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ARFIP2P53365 341 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SHC2P98077 582 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CTBP1Q13363 440 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 AGBL2Q5U5Z8 902 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 Q5W150 140 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 XRRA1Q6P2D8 792 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 MZT2AQ6P582 158 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF841Q6ZN19 808 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 KRBA2Q6ZNG9 492 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ASB18Q6ZVZ8 466 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMEM61Q8N0U2 210 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMEM217Q8N7C4 229 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 LRRC15Q8TF66 581 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ARSGQ96EG1 525 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CFAP57Q96MR6 1250 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PSMB7Q99436 277 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GMLQ99445 158 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 MPHOSPH8Q99549 860 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF577Q9BSK1 485 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SYT17Q9BSW7 474 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 VTA1Q9NP79 307 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 C14orf119Q9NWQ9 140 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PADI1Q9ULC6 663 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 BRWD3Q6RI45 1802 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 TRIM75PA6NK02 468 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SHISA7A6NL88 538 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 AQP7P3A6NL99 342 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 E7ENQ6 273 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 SOCS6O14544 535 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF823P16415 610 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 C5AR1P21730 350 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 MST1P26927 711 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 CD34P28906 385 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 PPOXP50336 477 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF136P52737 540 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 WNT4P56705 351 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 B3GALT5-AS1P59052 145 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD30.1-201ENST00000391309 STK3Q13188 491 aa-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms