RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SGO2Q562F6 1265 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LGSNQ5TDP6 509 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT80Q6KB66 452 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BTN2A1Q7KYR7 527 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYVN1Q86TM6 617 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LUZP1Q86V48 1076 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HOOK3Q86VS8 718 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF280BQ86YH2 543 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SIAH3Q8IW03 269 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RFWD2Q8NHY2 731 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R36Q96LQ0 422 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYRFLQ96LU7 910 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GSDMAQ96QA5 445 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBCDQ9BTW9 1192 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RMI1Q9H9A7 625 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC1Q9NV70 894 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DTLQ9NZJ0 730 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GDAQ9Y2T3 454 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ACTL7AQ9Y615 435 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZZEF1O43149 2961 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRG0 241 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 F8WDY8 70 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 J3KTA2 159 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTGESO14684 152 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG3O60359 315 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM13O60858 407 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RHOBTB1O94844 696 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 REC8O95072 547 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS23O95084 383 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 YEATS4O95619 227 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ALPPP05187 535 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ALPPL2P10696 532 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FERP16591 822 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH1A3P47895 512 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NRIP1P48552 1158 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCR3P51677 355 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OLR1P78380 273 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLFN5Q08AF3 891 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NHSL2Q5HYW2 709 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD14BQ5SR56 506 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TTI2Q6NXR4 508 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM270Q6UE05 265 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TEPPQ6URK8 271 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ACAD11Q709F0 780 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 USP37Q86T82 979 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TXNRD3Q86VQ6 643 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LDHDQ86WU2 507 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL6Q8N531 539 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR10S1Q8NGN2 331 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1524Q8TCG1 905 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HASPINQ8TF76 798 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EPSTI1Q96J88 318 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HEMGNQ9BXL5 484 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VCXQ9H320 206 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DIABLOQ9NR28 239 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LANCL2Q9NS86 450 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL17Q9UF56 701 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FBN3Q75N90 2809 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANXA2P2A6NMY6 339 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 M0QYT0 321 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HCRTR2O43614 444 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPR32O75388 356 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BCAR3O75815 825 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CBX7O95931 251 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GAS8O95995 478 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CD1AP06126 327 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms