RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEPT1Q9Y6K0 416 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PR77 199 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2A25A4D2G3 310 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CGB1A6NKQ9 187 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MASP2O00187 686 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAMDEC1O15204 470 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNMTO43148 476 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLOD3O60568 738 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMD10O75832 226 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FTCDO95954 541 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPN2P17706 415 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGAP20933 346 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 AVPR1AP37288 418 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMB10P40306 273 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC15A1P46059 708 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAMPP49913 170 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSD17B4P51659 736 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFAP4P55083 255 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXF2Q12947 444 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTX1Q13505 466 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAE1Q13564 534 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYBPC2Q14324 1141 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCLAFQ15004 111 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASA2Q15283 850 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC39AQ5SRH9 613 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC30A6Q6NXT4 461 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRINP3Q76B58 766 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGFN1Q86VF2 1251 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMER2Q8N7J2 671 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 POC5Q8NA72 575 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCPH1Q8NEM0 835 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM174Q8WUU8 243 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM18Q96B42 140 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP7D2Q96T17 732 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIGMQ9H3S5 423 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASAH2Q9NR71 780 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 C5AR2Q9P296 337 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF711Q9Y462 761 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLIC4Q9Y696 253 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM169AQ9Y6X4 670 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A096LPK6 155 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 E5RJQ4 531 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 OVOL3O00110 214 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAF4O00268 1085 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2CO00762 179 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIMM23O14925 209 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP2A1O14983 1001 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 LDB2O43679 373 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFB8O95169 186 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCL10O95999 233 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRF1P10914 325 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP9P14780 707 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHRNB2P17787 502 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNFRSF1BP20333 461 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIK3CAP42336 1068 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 GDF5P43026 501 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDH12P55289 794 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SELENOVP59797 346 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBXN2AP68543 259 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBED6P86452 979 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSF1Q00613 529 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ECT2LQ008S8 904 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 ID2Q02363 134 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM27E3Q08E93 113 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPS8Q12929 822 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDC16Q13042 620 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRYMQ14894 314 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms