RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365289.1

RNU6-742P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 742, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-742P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-742P-201ENST00000365289 SLC25A41Q8N5S1 370 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 C2orf69Q8N8R5 385 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 FAM71DQ8N9W8 422 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 BBS10Q8TAM1 723 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RSAD2Q8WXG1 361 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KAT2AQ92830 837 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TVP23CQ96ET8 276 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 LINGO1Q96FE5 620 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CDCA5Q96FF9 252 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CALML4Q96GE6 196 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 IMMP1LQ96LU5 166 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 FOPNLQ96NB1 174 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 P2RY12Q9H244 342 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ERVK-5Q9HDB9 667 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 Q9N2K0 584 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 AK5Q9Y6K8 562 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 EMSYQ7Z589 1322 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 hDV102S1A0JD36 115 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RRN3P2A6NIE6 340 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CCDC85CA6NKD9 419 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 DUXAA6NLW8 204 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ICOSLGO75144 302 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 MMP2P08253 660 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SP9P0CG40 484 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 MYF5P13349 255 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 HLA-DOBP13765 273 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CPN1P15169 458 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CRISP2P16562 243 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 NPR2P20594 1047 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 OXTRP30559 389 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 GNA15P30679 374 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TNFSF8P32971 234 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 UQCRFS1P47985 274 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PPP3CCP48454 512 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ERVPABLB-1P60509 514 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 WDR5P61964 334 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 GPC5P78333 572 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 DEFB103AP81534 67 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SP3Q02447 781 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PAX5Q02548 391 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ACVR1Q04771 509 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PKP1Q13835 747 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 NTRK3Q16288 839 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PPP2R5EQ16537 467 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 IL17AQ16552 155 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CDKN3Q16667 212 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 HLA-BQ31612 363 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RAET1LQ5VY80 246 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 HCP5Q6MZN7 132 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CRTC1Q6UUV9 634 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZFP2Q6ZN57 461 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SYVN1Q86TM6 617 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KMT5CQ86Y97 462 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 FAM185AQ8N0U4 392 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 GPC2Q8N158 579 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KLHDC1Q8N7A1 406 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 MCPH1Q8NEM0 835 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 OR14C36Q8NHC7 312 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZNF596Q8TC21 504 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TMEM163Q8TC26 289 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 STT3BQ8TCJ2 826 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KAT5Q92993 513 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SCAMP4Q969E2 229 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 PTERQ96BW5 349 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CRBNQ96SW2 442 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CDRT15Q96T59 188 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 KRT12Q99456 494 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPIN2AQ99865 258 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 DGCR6LQ9BY27 220 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SIK2Q9H0K1 926 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 CSTL1Q9H114 145 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RAB21Q9UL25 225 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TPCN1Q9ULQ1 816 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 TRAF6Q9Y4K3 522 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPO11Q9Y5K1 396 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 RAI2Q9Y5P3 530 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 UNC79Q9P2D8 2635 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 ASXL2Q76L83 1435 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-742P-201ENST00000365289 BLACEA4D250 179 aa-1.51□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms