RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMEL1Q495T6 779 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNDC8Q6A555 127 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCTLQ6UWM7 567 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLK2Q6UY11 383 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRPQ86YL5 185 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSELQ8IZU8 1212 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 BEST2Q8NFU1 509 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTRA1Q92743 480 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL29Q96CT2 875 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HVCN1Q96D96 273 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 BICD1Q96G01 975 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOCK7Q96N67 2140 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17FQ96PD4 163 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 VEZTQ9HBM0 779 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOX4Q9NPH5 578 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP6Q9NZW5 540 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC36A6NLP5 189 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOCS6O14544 535 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLGNO14967 610 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 BUB3O43684 328 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFS7O75251 213 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2P2O95744 297 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFP02787 698 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP2P08253 660 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX7A2P14406 83 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP20933 346 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 STX2P32856 288 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAFAH1B1P43034 410 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU5F1BQ06416 359 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFAIP1Q13829 316 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAK1Q16611 211 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMZ1Q400G9 498 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMC5Q8IY18 1101 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB2Q8N680 514 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESX1Q8N693 406 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF125Q96EQ8 232 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf30Q96M34 536 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSF3RQ99062 836 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KXD1Q9BQD3 176 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCND2Q9NZV8 630 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJD2Q9UKL4 321 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCN5AQ14524 2016 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM202A6NGA9 273 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDLRAD4O15165 306 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIPRLO75663 272 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF432O94892 652 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN14O95500 239 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYGLP06737 847 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00271P0C7V0 271 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCD1P33897 745 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGO1Q5FBB7 561 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZTC4 211 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTSS1LQ765P7 747 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINGO2Q7L985 606 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUZD1Q86UP6 607 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA20Q8TB22 786 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST8SIA4Q92187 359 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms