RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA6P31267 233 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 LYSMD1Q96S90 227 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 MAGEE1Q9HCI5 957 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 HACD3Q9P035 362 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa27.9■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 AVPR2P30518 371 aa27.89■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 ABL2P42684 1182 aa27.89■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 FAM193AP78312 1265 aa27.89■■■□□ 2.06
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC73Q5JTD7 316 aa27.89■■■□□ 2.06
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GIPC1-201ENST00000345425 AP1G1O43747 822 aa27.88■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 IGLV3-19P01714 112 aa27.88■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 TPSD1Q9BZJ3 242 aa27.88■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 NPY2RP49146 381 aa27.88■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 TRABDQ9H4I3 376 aa27.88■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 B4GALT6Q9UBX8 382 aa27.88■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 NEMP1O14524 444 aa27.87■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 OXTRP30559 389 aa27.87■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 MMP12P39900 470 aa27.87■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 PXNP49023 591 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC24Q6UX98 284 aa27.87■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 CRTC1Q6UUV9 634 aa27.84■■■□□ 2.05
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GIPC1-201ENST00000345425 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 PREBQ9HCU5 417 aa27.84■■■□□ 2.05
GIPC1-201ENST00000345425 SDR42E2A6NKP2 422 aa27.83■■■□□ 2.05
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