RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PHC3Q8NDX5 983 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RHBGQ9H310 441 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL16O15467 120 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GCATO75600 419 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 AP2A1O95782 977 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT14O95848 222 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT2B4P06133 528 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SPACA7Q96KW9 195 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 12.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SVOPQ8N4V2 548 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HIC2Q96JB3 615 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ISM1B1AKI9 464 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HS6ST1O60243 411 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PRNPP04156 253 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NTRK1P04629 796 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINB1P30740 379 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 POLD2P49005 469 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PKNOX1P55347 436 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TNS4Q8IZW8 715 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GLMNQ92990 594 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 C2P06681 752 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PBX3P40426 434 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 STYXQ8WUJ0 223 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF711Q9Y462 761 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PHLPP1O60346 1717 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PIAS1O75925 651 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CRATP43155 626 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCR3P49682 368 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EPS8Q12929 822 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PLD4Q96BZ4 506 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 LZTS1Q9Y250 596 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN2P17706 415 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NDST2P52849 883 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 AP1S1P61966 158 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS1Q08116 209 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 DAW1Q8N136 415 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 COPZ1P61923 177 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR180Q86V85 440 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 COL26A1Q96A83 441 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms