RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.1■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.1■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 FASNP49327 2511 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 CD160O95971 181 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 PARP6Q2NL67 630 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 CNTD1Q8N815 330 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 BBOF1Q8ND07 529 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 SNF8Q96H20 258 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 MGME1Q9BQP7 344 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 LHX3Q9UBR4 397 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 DKK4Q9UBT3 224 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 SPEGQ15772 3267 aa16.09■□□□□ 0.17
IFT20-201ENST00000322326 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 E7EVH7 732 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 K7ERQ8 282 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ATP9BO43861 1147 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IGSF6O95976 241 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MT-CO1P00395 513 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CES1P23141 567 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PSMB4P28070 264 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SLC7A5Q01650 507 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GUCY2DQ02846 1103 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ACCSLQ4AC99 568 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FCRL5Q96RD9 977 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DPH5Q9H2P9 285 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FBRSQ9HAH7 460 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RAXQ9Y2V3 346 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ACACAQ13085 2346 aa16.08■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PSMD3O43242 534 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TNFSF14O43557 240 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ANXA9O76027 345 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DKK1O94907 266 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GSRP00390 522 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 HLA-EP13747 358 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ACSL1P33121 698 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GRIA4P48058 902 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MAXP61244 160 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB16Q05516 673 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CALCOCO2Q13137 446 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DLG2Q15700 870 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PTPRNQ16849 979 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 KIF19Q2TAC6 998 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DUPD1Q68J44 220 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PCGF5Q86SE9 256 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IFT20Q8IY31 132 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SEMA3CQ99985 751 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 WHRNQ9P202 907 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 F5H423 210 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SMAPO00193 183 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MUSKO15146 869 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 METTL18O95568 372 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms