RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 MUS81Q96NY9 551 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CENPOQ9BU64 300 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 METTL18O95568 372 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CHRNB1P11230 501 aa16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 SLC22A2O15244 555 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 NR2C2P49116 596 aa16.68■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ULK4Q96C45 1275 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 GAD1Q99259 594 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 KLHL3Q9UH77 587 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 AKT3Q9Y243 479 aa16.68■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 PDE9AO76083 593 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MTHFRP42898 656 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 DAW1Q8N136 415 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 DYRK4Q9NR20 520 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 NOBOXO60393 691 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 KATNA1O75449 491 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 VDRP11473 427 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 LIPEQ05469 1076 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 GLYATQ6IB77 296 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 RASSF1Q9NS23 344 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 OLAHQ9NV23 265 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 BTRCQ9Y297 605 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 AQP12BA6NM10 295 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 TPSAB1Q15661 275 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 TRIQKQ629K1 86 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MAPK15Q8TD08 544 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 EXD2Q9NVH0 621 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CNTN3Q9P232 1028 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.67■□□□□ 0.26
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PACS1-201ENST00000320580 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.67■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 AIREO43918 545 aa16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 TM4SF1P30408 202 aa16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 HLCSP50747 726 aa16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 LIMK2P53671 638 aa16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 MADCAM1Q13477 382 aa16.66■□□□□ 0.26
PACS1-201ENST00000320580 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.66■□□□□ 0.26
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