RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM14Q96QK8 99 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TRIB3Q96RU7 358 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LAMA1P25391 3075 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0J9YYE9 177 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MMP20O60882 483 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TRBC1P01850 177 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GRIA4P48058 902 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 DPPA4Q7L190 304 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PIGKQ92643 395 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SCRN2Q96FV2 425 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PAK5Q9P286 719 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 IGLON5A6NGN9 336 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 NDST3O95803 873 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 HNF1BP35680 557 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 QPCTQ16769 361 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF284Q2VY69 593 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LOXL4Q96JB6 756 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 FICDQ9BVA6 458 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf142B7Z368 130 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LATO43561 262 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ELFN1P0C7U0 828 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 VIPR1P32241 457 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 FNTAP49354 379 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LIG3P49916 1009 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RALGDSQ12967 914 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 EBF2Q9HAK2 575 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PPC4 97 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN8A6NHC0 703 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PROB1E7EW31 1015 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SLC31A1O15431 190 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TM7SF2O76062 418 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 EPN2O95208 641 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CD27P26842 260 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 FDFT1P37268 417 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CHRNA4P43681 627 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SGCGQ13326 291 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF7Q14155 803 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 DENND2CQ68D51 928 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC45Q96CN5 670 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0U1RQS6 177 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 E7EVH7 732 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 AGTP01019 485 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 EPOP01588 193 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 KRT14P02533 472 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PIRTP0C851 137 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 C6P13671 934 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LHCGRP22888 699 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 VPS41P49754 854 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 OLIG2Q13516 323 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SPARCL1Q14515 664 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms