RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 HMCESQ96FZ2 354 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEH1Q9H213 219 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DONSONQ9NYP3 566 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP6Q9NZW5 540 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1A2Q9Y585 309 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 COL12A1Q99715 3063 aa7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVL5 298 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GAT1O43505 415 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RAMP2O60895 175 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAP2O75791 330 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMPSTE24O75844 475 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 THRAP10827 490 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNB1P14635 433 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT9P35527 623 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOAP61586 193 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A3Q01959 620 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DPYDQ12882 1025 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DRC7Q8IY82 874 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PDXPQ96GD0 296 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP63Q96MT8 703 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC38A3Q99624 504 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR26Q9H7D7 661 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CASS4Q9NQ75 786 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.91□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 NBASA2RRP1 2371 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SDK2Q58EX2 2172 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF103O00237 685 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA7O14818 248 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 BUB1O43683 1085 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 STK17BO94768 372 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SMC2O95347 1197 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GNA14O95837 355 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RECKO95980 971 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CD1CP29017 333 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTP40126 519 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 USP8P40818 1118 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PGDP52209 483 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MC2RQ01718 297 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PTK2Q05397 1052 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF5Q15542 800 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 UGP2Q16851 508 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKS6Q68DC2 871 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 AVL9Q8NBF6 648 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RTP4Q96DX8 246 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf34Q96MH7 638 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGVQ9NUD9 493 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP10Q9P2G4 905 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.9□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.9□□□□□ -1.14
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