RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-201ENST00000291574 OAZ1P54368 228 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGA7Q13683 1181 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 QPRTQ15274 297 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.66□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC15A2Q16348 729 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.66□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13.66□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 JAM2P57087 298 aa13.66□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.66□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 EPHB3P54753 998 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 GALNT3Q14435 633 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 GLYATQ6IB77 296 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MADCAM1Q13477 382 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 SDE2Q6IQ49 451 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MON1BQ7L1V2 547 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 TIMM22Q9Y584 194 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 HAT1O14929 419 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADORA2AP29274 412 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 VSTM1Q6UX27 236 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 POMPQ9Y244 141 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 TP73O15350 636 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGSF6O95976 241 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERPINA1P01009 418 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 DGKZQ13574 1117 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 MFSD10Q14728 455 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 RFX4Q33E94 735 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 POTEHQ6S545 545 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 STARD8Q92502 1023 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITSN1Q15811 1721 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.65□□□□□ -0.22
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TRAPPC10-201ENST00000291574 AKAP14Q86UN6 197 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINGO1Q96FE5 620 aa13.64□□□□□ -0.23
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLIN3O60664 434 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 HNF4AP41235 474 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 INSCQ1MX18 579 aa13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 DOK6Q6PKX4 331 aa13.64□□□□□ -0.23
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.64□□□□□ -0.23
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