RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH9Q9ULB4 789 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 IGLV3-25P01717 112 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HLA-DQB2P05538 268 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A2P52569 658 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM17P78536 824 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TCF12Q99081 682 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PLXNB2O15031 1838 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MYLKQ15746 1914 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PMPCBO75439 489 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LAYNQ6UX15 382 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF135Q8IUD6 432 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SCML4Q8N228 414 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.24■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TIPRLO75663 272 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 STAMBPO95630 424 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CKMT2P17540 419 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR7P34969 479 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT7Q86SF2 657 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFP42Q96MM3 310 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF839A8K0R7 811 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SOCS2O14508 198 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GPX3P22352 226 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 YWHAQP27348 245 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT6Q14141 434 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ARTNQ5T4W7 220 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MANEALQ5VSG8 457 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.23■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V1B2P21281 511 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PLK1P53350 603 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF21BQ96EK2 531 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SIK2Q9H0K1 926 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A3P40879 764 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LPIN1Q14693 890 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 BEND5Q7L4P6 421 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX31Q8N9S9 440 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 AQP12BA6NM10 295 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 AFMIDQ63HM1 303 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RETREG3Q86VR2 466 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 AQP12AQ8IXF9 295 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS45Q9NRW7 570 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIA3P42263 894 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 STX1BP61266 288 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 KDELC1Q6UW63 502 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM47BQ8NA70 645 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CDCA5Q96FF9 252 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 DLGAP1O14490 977 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GJA5P36382 358 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 NFKB2Q00653 900 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.21■■□□□ 1.15
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