RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639300.1

SCARB2-216, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,554 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-216ENST00000639300 TRIM38O00635 465 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RASSF9O75901 435 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TTPAP49638 278 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TAS2R39P59534 338 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 DPYSL2Q16555 572 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 STK40Q8N2I9 435 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SYT17Q9BSW7 474 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 GBA3Q9H227 469 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 E9PAM4 449 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RGS5O15539 181 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RUNX1T1Q06455 604 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RDH11Q8TC12 318 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TPD52L3Q96J77 140 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ABCG8Q9H221 673 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ZBTB14O43829 449 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TCEA3O75764 348 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 FGF1P05230 155 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 HSMCR30P0CW71 290 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CYP2A7P20853 494 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TMEM110Q86TL2 294 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 B3GALT6Q96L58 329 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PIGVQ9NUD9 493 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PADI4Q9UM07 663 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TIMM22Q9Y584 194 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 AK5Q9Y6K8 562 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RGS14O43566 566 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ULK1O75385 1050 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PSMB9P28065 219 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RALGDSQ12967 914 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PRKG2Q13237 762 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.49□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SPATA31D3P0C874 917 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 DGKAP23743 735 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CHN2P52757 468 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MTA1Q13330 715 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CNSTQ6PJW8 725 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 BNIPLQ7Z465 357 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 LINGO1Q96FE5 620 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 HBEGFQ99075 208 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 FZD10Q9ULW2 581 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 VPS4BO75351 444 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ETS2P15036 469 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PIK3CGP48736 1102 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PFKPQ01813 784 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MPP2Q14168 576 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SPRYD7Q5W111 196 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 UCMAQ8WVF2 138 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MAGED4Q96JG8 741 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TEKT5Q96M29 485 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 LRP6O75581 1613 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 NRP2O60462 931 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PCDH8O95206 1070 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 MC4RP32245 332 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 OLIG2Q13516 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 KCNA10Q16322 511 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 CCL14Q16627 93 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 TRIM16LQ309B1 348 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.48□□□□□ -0.09
SCARB2-216ENST00000639300 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms