RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TBX21	Q9UL17	535 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CEP350	Q5VT06	3117 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM72C	H0Y354	149 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659		H7C4K7	107 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GCAT	O75600	419 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SULT1C4	O75897	302 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-25	P01717	112 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CDKL1	Q00532	357 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GAD2	Q05329	585 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IKBKE	Q14164	716 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DDR2	Q16832	855 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MBLAC2	Q68D91	279 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM72B	Q86X60	149 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ATP2A3	Q93084	1043 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RNF34	Q969K3	372 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM64B	A6NI03	449 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659		K7EPI3	171 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DCLK1	O15075	740 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD11	O43934	449 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GLRA3	O75311	464 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	AMH	P03971	560 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	INHBB	P09529	407 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GPR15	P49685	360 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ARPP19	P56211	112 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TPI1	P60174	286 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KCNJ11	Q14654	390 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CES4A	Q5XG92	561 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf46	Q6P387	395 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PPM1N	Q8N819	430 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KY	Q8NBH2	561 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CNDP1	Q96KN2	507 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SCML2	Q9UQR0	700 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		15.42	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IRAK2	O43187	625 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D4	O60343	1298 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FUCA1	P04066	466 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CPB1	P15086	417 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PBX3	P40426	434 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HK2	P52789	917 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GPR17	Q13304	367 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PDK1	Q15118	436 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PIGG	Q5H8A4	983 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IL23R	Q5VWK5	629 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MON1A	Q86VX9	555 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NMUR1	Q9HB89	426 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQH9	124 aa		15.41	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DYTN	A2CJ06	578 aa		15.41	■□□□□ 0.06

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