RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EXOC2Q96KP1 924 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TBATAQ96M53 351 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.154e-10■■■□□ 16.4
SRRT-218ENST00000620394 PIGNO95427 931 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ZNF165P49910 485 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 YPEL5P62699 121 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ELP6Q0PNE2 266 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CDKN3Q16667 212 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RFX8Q6ZV50 586 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ARL14Q8N4G2 192 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TRIM7Q9C029 511 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.24■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 J3KR12 359 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TPP1O14773 563 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 AQP9O43315 295 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MMP20O60882 483 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 JUNDP17535 347 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CSNK1DP48730 415 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PTK2BQ14289 1009 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 IQCB1Q15051 598 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 FIGNQ5HY92 759 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 GUSBP11Q6P575 273 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MACC1Q6ZN28 852 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CLEC14AQ86T13 490 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 VPS36Q86VN1 386 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SCINQ9Y6U3 715 aa22.23■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CPED1A4D0V7 1026 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 LRCH4O75427 683 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RNF8O76064 485 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ITIH2P19823 946 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MIPP30301 263 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 THOP1P52888 689 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 AGERQ15109 404 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 UGP2Q16851 508 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NPWQ8N729 165 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 WDR48Q8TAF3 677 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TRIM11Q96F44 468 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.22■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RP1P56715 2156 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PRPSAP2O60256 369 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MYBL1P10243 752 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ERCC2P18074 760 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MMP12P39900 470 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RGRP47804 291 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 HCAR3P49019 387 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 DPYSQ14117 519 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NR1I3Q14994 352 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 IRF4Q15306 451 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NR0B2Q15466 257 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RBFAQ8N0V3 343 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NAT6Q93015 286 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ZNF653Q96CK0 615 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 LRRC61Q9BV99 259 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ISCUQ9H1K1 167 aa22.21■■□□□ 1.15
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