RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR70Q9NW82 654 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 DACH1Q9UI36 760 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR1BP28222 390 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SUOXP51687 545 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 UGP2Q16851 508 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF26BQ2KJY2 2108 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 EFHC2Q5JST6 749 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GKN2Q86XP6 184 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PDXPQ96GD0 296 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 KLQ9UEF7 1012 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CCP110O43303 1012 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB3O43889 395 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PCCBP05166 539 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 INHBCP55103 352 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TGIF1Q15583 401 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP15Q460N3 678 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM9Q86XI8 627 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 JAMLQ86YT9 394 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS16Q9H269 839 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN3Q9H3W5 708 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SUV39H2Q9H5I1 410 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 WASH4PA8MWX3 477 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NOBOXO60393 691 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCGP05129 697 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LIG3P49916 1009 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf20Q8ND61 904 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HCAR2Q8TDS4 363 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.731e-7■■■□□ 16.1
CAPNS1-211ENST00000590874 STRADBQ9C0K7 418 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PDFQ9HBH1 243 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD10Q9ULW2 581 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC28A2O43868 658 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CCKBRP32239 447 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP12P39900 470 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 AGERQ15109 404 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTPA2Q8IWL1 248 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR156Q8NFN8 814 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR92Q96MX6 357 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PISDQ9UG56 409 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP4O75096 1905 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 J3KR12 359 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MTM1Q13496 603 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ERAP2Q6P179 960 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNJLQ8IV13 435 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 EXD3Q8N9H8 876 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1E3Q8WZA6 343 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM74Q96NL1 305 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LOXL2Q9Y4K0 774 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKBQ9Y6T7 804 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 AGRPO00253 132 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFP01375 233 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CALB1P05937 261 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT1P42224 750 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RGRP47804 291 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM3Q14832 879 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT31Q15323 416 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00303Q3SY05 128 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MON1BQ7L1V2 547 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C4Q8NGE1 309 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ATL2Q8NHH9 583 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MCEEQ96PE7 176 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CLMPQ9H6B4 373 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC19Q9H756 370 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF22Q9HCT0 170 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM202A6NGA9 273 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 JMJD7P0C870 316 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ITIH1P19827 911 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RALGDSQ12967 914 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms