RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 AGPAT1Q99943 283 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NCAPGQ9BPX3 1015 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PADI4Q9UM07 663 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PCCBP05166 539 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TPM2P07951 284 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 XPAP23025 273 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RPIAP49247 311 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 UCNP55089 124 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TPI1P60174 286 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CFHR1Q03591 330 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ELP6Q0PNE2 266 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RALGDSQ12967 914 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SPIDRQ14159 915 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 INPP5AQ14642 412 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 NFATC4Q14934 902 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CA9Q16790 459 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 DNAAF5Q86Y56 855 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 NPWQ8N729 165 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PLA2G15Q8NCC3 412 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 NEK11Q8NG66 645 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TTC9Q92623 222 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 NSMCE3Q96MG7 304 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ERGIC2Q96RQ1 377 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PEBP4Q96S96 227 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CNPY3Q9BT09 278 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FOXP3Q9BZS1 431 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SUV39H2Q9H5I1 410 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 GULP1Q9UBP9 304 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PQM1 296 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 D6RAR5 112 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TOR1BO14657 336 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF11O60813 436 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TNFSF15O95150 251 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RASGRP1O95267 797 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 LIG3P49916 1009 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PEX5P50542 639 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 AIF1P55008 147 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 MYL5Q02045 173 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 UBXN1Q04323 297 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 VAC14Q08AM6 782 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CLN3Q13286 438 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 LY6DQ14210 128 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CLEC14AQ86T13 490 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 MCOLN2Q8IZK6 566 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PELI3Q8N2H9 469 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 GLMNQ92990 594 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 GRAMD1AQ96CP6 724 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SYT11Q9BT88 431 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 APOOQ9BUR5 198 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 DPH1Q9BZG8 443 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 EDEM3Q9BZQ6 932 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TRIM7Q9C029 511 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FGF22Q9HCT0 170 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 KLQ9UEF7 1012 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 DOLKQ9UPQ8 538 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TENM4Q6N022 2769 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CCDC187A0A096LP49 1063 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TMEM202A6NGA9 273 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ALPIP09923 528 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms