RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NUDT2P50583 147 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ARSDP51689 593 aa15.17■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CYS1Q717R9 158 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SNX32Q86XE0 403 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DRC3Q9H069 523 aa15.17■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 TIMM22Q9Y584 194 aa15.16■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.15■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 CLEC14AQ86T13 490 aa15.15■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 109.9
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.15■□□□□ 0.02
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CTIF-205ENST00000587860 RHOJQ9H4E5 214 aa15.15■□□□□ 0.02
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